Tal e qual o pai, Eric dá seu golpe para conseguir a chefia do projeto secreto de estudo dos alienígenas. Dez anos depois as investigações continuam, mas muita coisa vai mudar.
Jesse leva uma vida comum, mas só até ser abduzido de novo. Ele começa a agir como Russel e faz a esposa. Amelia, acreditar que ele está tendo alucinações. O filho, Charlie, se assusta com as reações do pai, mas é o próximo na lista dos alienígenas.
Jesse vai atrás de um médico para retirar o 'tumor', que na verdade é um rastreador, mas cai numa armadilha. Os médicos eram agentes do governo que pretendiam usá-lo para atrair os ETs. Jesse descobre e escapa e encontra Charlie já em poder de um dos aliens, que havia se transmutado em sua figura. A partir daí, ele já não interessa mais e o rastreador é expelido. Agora Amelia vai tentar evitar que o filho seja abduzido, assim como Jesse foi, durante a vida inteira.
Jacob reaparece. E é justamente nos momentos finais da vida de sua mãe que Tom finalmente acredita ter um irmão meio alienígena. E essa nova crença faz Tom atrair a atenção de Eric Crawford, que procura Beckie, a outra irmã, para tentar arrancar alguma informação sobre Jacob. O feitiço vira contra o feiticeiro quando Eric e Beckie se apaixonam. Ele acredita que ela é a mulher que vai ajudá-lo a mudar e mostra o corpo de um dos ETs capturados em Roswell. Mas, com toda a situação do passado entre suas famílias, os planos de ficarem juntos dão errado, assim como a mudança que Eric fazia de seu escritório para o Maine. Durante o trajeto a nave-mãe volta para recuperar a nave de Roswell, em poder do governo desde 1947, deixando todos os presentes completamente boquiabertos.